Agents chimiques pour la détermination de structures de protéines

La détermination de structures tridimensionnelles des protéines est essentielle à l’étude de leur fonction in vivo. Des stratégies alternatives à l’utilisation de méthodes d’analyse à haute résolution ont été développées dans le but de lever certaines contraintes (e.g. nécessité de quantités de protéines pures cristallisées importantes pour réaliser des expériences de diffraction des rayons X). Ces méthodes sont basées sur l’utilisation conjointe d’agents chimiques de modification de protéines et de l’analyse par spectrométrie de masse. Elles permettent d’obtenir efficacement des données structurales variées (e.g. accessibilité au solvant, contraintes de distances, sites de modifications post-traductionnelles) basse résolution. La difficulté majeure à l’obtention de ces données reste cependant la détection de peptides d’intérêt faiblement représentés dans un mélange complexe. Trois projets ont été initiés durant ces travaux de recherche dans le but d’améliorer cette détection en spectrométrie de masse afin de fournir plus rapidement des données structurales.